Secteurs
Recherche scientifique
Développement de logiciels scientifiques, de pipelines d’analyse et de plateformes de calcul. Ingénierie des données expérimentales, bioinformatiques ou d’enquête, avec bases de données, applications et outils d’IA intégrés aux méthodes de recherche.
Données expérimentales, calculs et résultats scientifiques
Un résultat scientifique est relié aux données d’entrée, aux paramètres, au code et à l’environnement de son calcul. Les pipelines organisent ces références avec les sorties et les journaux d’exécution. Les espaces de travail temporaires, les jeux de données conservés et les dépôts de publication remplissent des fonctions différentes dans ce cycle.
Exemples de données traitées dans ce secteur
Acquisition et annotations
Fichiers d’instruments, séquences, images, enquêtes et annotations documentent les observations et leurs conditions de collecte.
Exécution des analyses
Versions du code, paramètres, dépendances, jobs et journaux permettent de relier chaque sortie à son traitement.
Conservation et partage
Métadonnées, identifiants persistants, licences et règles d’accès accompagnent les jeux de données conservés ou publiés.
Pratiques et systèmes documentés en Suisse
Sources publiques décrivant les pratiques d’organisations et les interfaces de logiciels. Les réalisations PERINGER sont présentées séparément plus bas.
Prestations d’ingénierie
Pipelines scientifiques et bioinformatiques
Développement et orchestration des traitements depuis les fichiers d’entrée jusqu’aux résultats. Intégration des outils spécialisés, contrôle des formats et conservation des paramètres et journaux associés à chaque exécution.
Plateformes et entrepôts de données →Calcul parallèle et environnements reproductibles
Conteneurisation des applications, préparation des dépendances et déploiement des jobs sur les ressources HPC ou cloud retenues. Parallélisation des traitements et organisation des échanges entre stockage de travail et données conservées.
Automatisation des infrastructures →Bases, métadonnées et interfaces de données
Modélisation des échantillons, observations, annotations et résultats. Développement de catalogues, d’API et d’outils de collecte pour rechercher les données et préserver leurs liens avec les protocoles et références utilisés.
API et intégration des systèmes →Applications d’analyse et visualisation
Notebooks, outils en ligne de commande et interfaces web pour préparer les jeux de données et examiner les résultats. Développement d’exports et de graphiques conservant les références nécessaires à leur interprétation.
Logiciels et applications sur mesure →IA et exploration documentaire
Recherche dans les corpus scientifiques, extraction d’informations et intégration de modèles d’analyse. Les API et agents accèdent aux outils et jeux de données autorisés, avec références aux sources et suivi des exécutions.
Recherche documentaire et bases de connaissances →
Protection des données et sécurité des systèmes
Le cadre de protection des données dépend du statut de l’organisation et des traitements. Pour les traitements soumis à la LPD révisée, souvent appelée nLPD, les mesures de sécurité et les paramètres de protection sont définis dès la conception, en fonction des risques.
Le statut de l’institution, les données utilisées et les conditions du financement déterminent les règles de conservation et de partage. La recherche sur l’être humain relève d’un cadre spécifique lorsqu’elle entre dans son champ. Un dépôt de données peut prévoir un accès restreint pour respecter les droits des personnes, les accords et les licences. Source officielle
Mesures techniques à définir selon les traitements
- Accès par projet, protection des données identifiantes et traçabilité des exports
- Versions des jeux de données, paramètres et environnements conservées avec les résultats
- Stockage temporaire séparé des données à conserver, transferts vérifiés et restaurations testées
Repères techniques · PFPDT · OFCS
Cadre légal, prestataires et incidents
Finalités, conservation et droits
La conception précise les données collectées, leur utilisation, les destinataires et les durées de conservation. Elle prévoit l’information des personnes et le traitement de leurs demandes d’accès ou de rectification. Les obligations de registre et de documentation sont examinées selon les traitements et les exemptions applicables.
Hébergement et sous-traitants
L’organisation reste responsable lorsqu’elle confie des données à un prestataire. L’examen couvre les contrats, les sous-traitants ultérieurs, les lieux de traitement et les accès depuis l’étranger. Un hébergement hors de Suisse est possible sous les conditions de protection applicables aux transferts.
Analyse des risques et incidents
Une analyse d’impact relative à la protection des données (AIPD) est requise lorsque le traitement envisagé est susceptible de présenter un risque élevé pour les personnes. Le responsable du traitement annonce une violation de sécurité au PFPDT dans les meilleurs délais lorsqu’elle entraîne vraisemblablement un risque élevé pour leur personnalité ou leurs droits fondamentaux.
Réalisations associées
Recherche scientifique
Automatisation et calcul haute performance pour l’astronomie
Automatiser le build et le déploiement d’applications C# d’analyse astronomique sur un cluster de calcul haute performance avec GitLab, Docker et Kubernetes.
Recherche scientifique
Développement logiciel pour la recherche en génétique
Développer des outils de collecte, de traitement et d’analyse des données de séquençage pour la recherche en génétique.
Recherche scientifique
Préparation et documentation de données d’enquête
Transformer les données brutes d’une enquête en jeux documentés, avec des procédures de nettoyage et des définitions de variables réutilisables.
Pour approfondir
Parlons de votre projet
Un échange sur la conception, le développement et la mise en production de votre projet.